Wówczas, w 1999 roku, z toruńskiego lotniska papamobile przejechał na starówkę, gdzie papieża witały tłumy wiernych. W Domu Biskupów przy ul.Łaziennej zjadł obiad i prywatnie udał się do katedry śś.Janów. Tego nie było w planie wizyty. Późne popołudnie to uroczysta msza na lotnisku, na Jana Pawła II oczekiwało ponad 300 tysięcy osób. Każde niemal zdanie kończyło się owacją, zwłaszcza słynne "Pozdrawiam bliski mojemu sercu Toruń i piękne Pomorze Nadwiślańskie". W powitaniu nawiązał też do postaci Mikołaja Kopernika i historii miasta, m.in. Colloquium Charitativum oraz I i II Pokoju Toruńskiego.
Podczas mszy w Toruniu beatyfikował księdza Stefana Wincentego Frelichowskiego, patrona harcerzy polskich. Na lotnisku do Wielkiej Księgi Darów Diecezji Toruńskiej wpisało się kilkanaście tysięcy osób. W trakcie wizyty doszło do pierwszego w historii spotkania ze światem nauki w świeckiej uczelni. W Auli UMK oczekiwało na papieża ponad tysiąc osób, przede wszystkim rektorzy wszystkich szkół wyższych w Polsce. Przewodnim tematem było nawiązanie do papieskiej encykliki "Fides et Ratio" (Wiara i rozum). Przed odlotem Ojciec Święty spotkał się jeszcze ze swoją rodziną, mieszkającą w Toruniu.
Św.Jan Paweł II jest patronem województwa kujawsko-pomorskiego i Honorowym Obywatelem Torunia. Z uwagi na koronawirusa, obchody 100. rocznicy urodzin Papieża-Polaka wyglądają inaczej. Sporo działań jest w Internecie - konkursy, transmisje, pokazy. Samorząd województwa rozpoczął je w weekend. Wczoraj (17 maja) na fasadzie Urzędu Marszałkowskiego i przed budynkiem odbyła się multimedialna prezentacja, poświęcona św.Janowi Pawłowi II. Natomiast dzisiaj (18 maja) radni województwa spotkają się na uroczystej sesji sejmiku.